При загрузке сайта не отображается favicon, как это можно исправить?

Проверьте пути к favicon

У меня тоже была аналогичная проблема, работало в новых браузерах, а вот в ИЕ нет, а нужно всего лишь хорошую мета информацию <link rel="shortcut icon" href="src/img/primary/logo.png" type="image/x-icon" />

Иконка появится позже, если вы про Яндекс.
Он малость тугодумный - Выкачать иконку, размером 10кб с сайта - это дело 1 секунды. У него на это уходит до 14 дней. И то, пока сайт не появится в поиске - он будет писать предупреждения, что иконка не установлена (тыкай не тыкай, на кнопку проверить)