Как создать 2 базы данных?

Знаю данную особенность, сталкивался один раз сам. Попробуйте выйти из интерфейса phpMyAdmin с помощью кнопки "Выход", она ориентировочно слева-сверху располагается. После снова входим в phpMyAdmin из панели управления - вуаля, все базы отображаются.

Связано с этой с ошибкой в ПО phpMyAdmin, кэшем или чем-либо еще - мне неизвестно, но решение я предложил, пробуйте! :)

Интересно, а возникает ли такая проблема если ставить собственный phpMyAdmin с официального сайта в виде дистрибутива в отдельную папку на хостинге?

Для меня данная особенность не является критичной, но один из моих клиентов наотрез отказывается пользоваться "хостинговым" phpMyAdmin и всегда просит ставить самую актуальную версию. Желание клиента - закон, разумеется! :)

Возможно у Вас такой тарифный план. Префиксы никто не отменял, так что все сделать на одной базе