Почистить сайт от вирусов , вредоносных директив во множестве созданных файлов .htaccess.

Проблема возникает из-за вредоносных директив во множестве созданных файлов .htaccess. Пример такого файла /var/www/www-root/data/www/mebelhouse.su/.htaccess , в нем указаны следующие правила:

<FilesMatch ".(py|exe|phtml|php|PHP|Php|PHp|pHp|pHP|phP|PhP|php5|suspected)$">
Order allow,deny
Deny from all
</FilesMatch>
<FilesMatch "^(index.php|credits.php|customize.php|edit-comments.php|edit-tags.php|edit.php|checkbox.php|export.php|input.php|link.php|load-scripts.php|load-styles.php|dropdown.php|menu.php|nav-menus.php|network.php|options-discussion.php|options-general.php|options-permalink.php|options-privacy.php|options-reading.php|options-writing.php|plugins.php|post-new.php|post.php|privacy.php|profile.php|site-health.php|term.php|text.php|themes.php|tools.php|update-core.php|user-edit.php|user-new.php|users.php|wp-links.php|wp-login.php|wp-signup.php)$">
Order allow,deny
Allow from all
</FilesMatch>
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^index.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . index.php [L]


которые запрещают выполнение PHP скриптов из-за чего возникает ошибка на сайте. Судя по всему вредоносный скрипт, который попал на сервер через уязвимость CMS генерирует такие файлы.